Отделение абдоминальной онкологии является старейшим клиническим подразделением онкологического диспансера, которое было основано как общее хирургическое отделение в 1958 году. До 2014 года заведующий хирургическим отделением был Педченко Владимир Владимирович.

В настоящее время заведующий хирургическим отделением — Сексембаев Малик Жамалбаевич.

Процедурный кабинет оборудован новейшей техникой: термостат, размораживатель плазмы и растворов РП2-01 «БФА», Ампир -01 для подогрева крови и СЗП. Имеются инфузоматы-ДF -12М-(контролеры подачи) для дозированной подачи лекарственных препаратов(внутривенных растворов).

В перевязочном кабинете имеются камеры УФК 1-для безопасного хранения стерильного инструментария. Для точной ультразвуковой дезинфекции инструмента имеется аппарат УЗО-«Медал». Приобретен новейший функциональный операционный стол–трасформер регулируемый с помощью электропривода. В кабинетах проводится обеззараживание воздуха современным, безопасным аппаратом–«Рециркулятор». Хирургическое отделение оснащено новейшим оборудованием. В палатах имеются современные комфортные функциональные, удобные для ухода кровати, регулируемые с помощью электропривода. Ежедневно проводится врачебный и сестринский обход пациентов. Для обеспечения качественной медицинской помощи и достижение наилучших возможных результатов для людей, которым эта помощь оказывается. Требования пациента к качеству должны быть выполнены в обязательном порядке. Ибо основа обеспечения эффективной работы отделения служит конкурентоспособность, а значит —стабильность требуемого качества медицинской помощи. Ежегодно около 700 пациентов получают специализированное лечение в стационаре, около 100 в дневном стационаре. 15 % больных получают высокоспециализированную медицинскую помощь (ВСМП). Отделение является пионером в проведений органосохраняющего, комбинированного и комплексного лечения больных злокачественными новообразованиями. Основные направления работы отделения направлены на лечения злокачественных опухолей: органов брюшной полости, забрюшинного пространства, органов малого таза и мягких тканей, организация противораковой борьбы и методологическая помощь районам СКО. В соответствии с указанными направлениями проводятся следующие методики хирургического лечения: органосохраняющие, функционально-щадящие операции хирургические конструктивные операции и хирургическая реабилитация, эндоскопические операции.

Кадровый состав: в отделении работают 5 врачей, 11 мед сесетер, 9 санитарок.

Онко хирург Фрешер Виктор Владимирович, врач высшей категории, онкогинеколог Адильшин Амангельды Кужажевич, врач онкогинеколог Набиулина Наида Ахмедулаевна, врач-эпидемиолог, второй категории Газезова Аракся Артуровна, старшая медсестра, высшей категории Иванова Оксана Зиновьевна.